Sebuah anomali besar menghancurkan daratan di Jepang dan menghancurkan sebagian besar Tokyo, menenggelamkan tiga perempat kota ke laut.
Sepuluh tahun kemudian, narasinya bergeser ke Ganta Igarashi, seorang siswa yang tampaknya biasa-biasa saja menghadiri sekolah menengah di Prefektur Nagano. Sebagai pelarian, penyintas gempa yang fantastis, Ganta menjalani kehidupan yang teratur dan tidak memiliki ingatan akan bencana tersebut. Ini semua berubah ketika seorang pria aneh yang ditutupi baju besi ruby dan darah mengalir melalui jendela ruang kelasnya. Menyeringai gila, 'Manusia Merah' membantai seluruh kelas Ganta tapi bukannya membunuhnya, menyematkan pecahan kristal kemerahan di tubuh Ganta. Dalam beberapa hari setelah pembantaian tersebut, Ganta dijatuhi hukuman mati di Deadman Wonderland, sebuah penjara yang berfungsi ganda sebagai taman hiburan dan tunduk pada ruang sidang kanguru sebagai tergugat.
Sesampainya di penjara, Ganta dilengkapi menggunakan pemahaman unik yang melacak indikator penting dan tempatnya. Toksin yang mematikan secara terus-menerus disuntikkan ke dalam aliran darahnya melalui ambil, tetapi bagaimanapun, itu dapat dinetralkan dengan memiliki obat seperti manis setiap tiga kali, yang sering dilakukan melalui berbagai tindakan di penjara, yaitu melakukan untuk orang banyak , beroperasi di belakang panggung, membeli dengan faktor palsu (sejenis uang di antara tahanan di Deadman Wonderland), dll. Untuk mengumpulkan Cast Points, pelaku harus mengeksekusi dalam permainan mematikan fasilitas dan hidup. Beruntung bagi Ganta, seorang wanita misterius bernama Shiro, yang tampaknya memahami Ganta, dan dipahami oleh tahanan lain pada saat yang sama membantunya.
Sementara ingin hidup sebagai pelanggar hukuman mati, Ganta bermaksud mencari 'Manusia Merah' untuk membersihkan gelarnya. Pada giliran yang aneh, Ganta mulai memperoleh kemampuan untuk mengontrol darahnya, menjadikannya senjata untuk ide tersebut. Tanpa sepengetahuan Ganta, dia menjadi salah satu "Orang Mati" penjara, sejumlah tahanan yang terisolasi memiliki Cabang Dosa membuat mereka mampu mengendalikan darah mereka. Ganta dibuat untuk mengambil bagian dalam pertandingan kematian gladiator yang kejam yang disebut Carnival Corpse, yang pemirsa anonimnya membayar sejumlah besar uang untuk mengamati setelah keahliannya ditemukan. Dalam pertempuran panjangnya untuk hidup, dia berhasil berteman dengan beberapa orang yang dia lawan di stadion dan dengan bantuan mereka, Ganta melanjutkan pencariannya untuk menemukan identifikasi 'Manusia Merah', mengapa dia berubah menjadi orang mati, serta rahasia gelap yang disembunyikan oleh otoritas penjara
